肛门腺囊内充满肛门腺液，积久会变黑色或深咖啡色液状或泥状物。气味臭不可闻。当犬在排便时，肛门腺的开口随着肛门口打开 ，排出肛门腺液润滑肛门，使犬能顺利排便。狗在受到惊吓或紧张时，肛门括约肌会收缩，肛门腺液也会排出。肛门腺的另一个作用是犬之间的互相辨识，当狗狗见面的时候，会互相闻对方的屁股进行分辨。肛门腺液积累时间长了，就要进行必要的清洁，以防止其发炎。有时我们看到小狗往地上磨屁股，那就有可能是犬的肛门腺出口阻塞出现炎症了。轻度阻塞时，狗会在地上磨屁股或是翘脚舔屁股；严重时因肛门腺肿疼痛，会使犬排便困难，甚至会造成更大的病痛。所以对肛门腺的清洁不可不注意，最好在每次定期给犬洗澡之前进行挤压清洁，因为肛门腺液很臭，清洁后洗澡可去除臭味。